Ksantan saqichining yadrosida uning polisaxarid zanjiri yotadi; uning orqa suyagi uzun, chiziqli zanjir hosil qilish uchun -1,4 glikozid bog'lari orqali bir-biriga bog'langan glyukoza birliklaridan iborat. Ushbu umurtqa pog'onasining chiziqli tuzilishi butun molekula uchun barqaror iskala bilan ta'minlaydi, bu uning molekulalararo joylashishini va suvli eritmalar ichidagi struktura yaxlitligini saqlab qolishga imkon beradi. Aynan shu barqaror umurtqa pog'onasi ksantan saqichiga hatto past konsentratsiyalarda ham ajoyib yopishqoqlik va mukammal reologik xususiyatlarni namoyish etish imkonini beradi. Ushbu orqa miya bo'ylab o'ziga xos glyukoza birliklaridan cho'zilgan ksantan molekulasi mannoz, glyukuron kislotasi va mannozdan tashkil topgan trisaxarid yon zanjirlariga ega. Ushbu yon zanjirlardagi glyukuron kislotasi qoldiqlarida karboksil guruhlari (-COOH) mavjud bo'lib, ular natriy, kaliy yoki kaltsiy kabi metall ionlari bilan tuzlar-hosil qilib, ksantan kislotasini ksantan saqichiga aylantiradi. Bu yon zanjirlar molekulaning sterik tuzilishi va eruvchanligini oshiribgina qolmay, balki ksantan saqichini nyutondan tashqari suyuqlik xususiyatlariga ega; Bu shuni anglatadiki, uning eritmalari aralashtirish yoki kesish kuchlari ta'sirida yuqori suyuqlikni namoyon qiladi, lekin turib qolganda ularning mustahkamligini saqlab qoladi.
Ksantan saqichidagi karboksilat guruhlari uning molekulyar funksionalligida markaziy hisoblanadi. Metall ionlari bilan ionli aloqalar hosil qilish orqali ksantan saqichlari kislotalar, asoslar va tuzlarga qarshilik, shuningdek, ma'lum darajada issiqlik barqarorligiga ega bo'ladi. Ushbu tuz guruhlari molekulaning suvli muhitda barqarorligini mustahkamlaydi, bu esa unga murakkab sharoitlarda kolloid tuzilishini saqlab qolishga imkon beradi, shu bilan birga emulsifikatsiya, suspenziya va qalinlashuv kabi turli xil funktsiyalarni beradi. Binobarin, ksantan saqichlari bir vaqtning o'zida polimer polisakkarid va tuz{3}}asosidagi funktsional material bo'lib xizmat qiladi va oziq-ovqat, farmatsevtika, kosmetika va sanoat sohalarida muhim ahamiyatga ega va qo'llaniladi.
